Guzman Salazar frigavs tillsammans med fem andra män. När kidnappningen tog slut och var männen frigavs har inte avslöjats.
Beväpnade män kidnappade gruppen på en bar i Puerto Vallarta på måndagen. Guzman Salazar hör liksom sin far till ledarna för knarkkartellen Sinaloa och han har varit efterlyst sedan år 2009.
Det rivaliserande kartellen Jalisco misstänks stå bakom kidnappningen.
Den äldre Guzman är tillfångatagen och syftet är att överlämna honom till USA där åtal för knarkhandel och mord väntar honom
El Chapo figurerade i internationella rubriker efter att han rymt från fängelset Altiplano sommaren 2015. Han greps i januari.
